内容紹介
Clinical Application of NGS-Based Clinical Sequencing
Summary
Cancer Clinical Sequencing is a method for making the treatment decision for each cancer patient. Implication of the clinical sequencing is rapidly in progress in Japan. In general, the tumor FFPE samples obtained by biopsy or operatory resection are subjected to amplicon sequencing. The process was divided into pre-analysis, analysis, and post-analysis processes. Quality assurance and control are necessary for all process. In addition, the expert members for clinical sequencing team is essential to make clinical sequencing reports based on the NGS analysis.
要旨
次世代シーケンサー(NGS)を用いたがんの遺伝子解析に基づく治療選択はクリニカルシーケンスと呼ばれ,わが国でも実装に向けた取り組みが進められている。通常,ホルマリン固定パラフィン包埋標本を用い,amplicon sequencingにより体細胞変異などを検索する。それらにはプレアナリシス段階からポストアナリシス段階に分けられるが,それぞれの過程において品質保証,精度管理が必要である。実地臨床では,それらの遺伝子解析結果をレポートとして提出することが求められ,そのレポートを適切に作成するためのクリニカルシーケンスチームを構成する専門家の人材育成が急務である。
目次
Summary
Cancer Clinical Sequencing is a method for making the treatment decision for each cancer patient. Implication of the clinical sequencing is rapidly in progress in Japan. In general, the tumor FFPE samples obtained by biopsy or operatory resection are subjected to amplicon sequencing. The process was divided into pre-analysis, analysis, and post-analysis processes. Quality assurance and control are necessary for all process. In addition, the expert members for clinical sequencing team is essential to make clinical sequencing reports based on the NGS analysis.
要旨
次世代シーケンサー(NGS)を用いたがんの遺伝子解析に基づく治療選択はクリニカルシーケンスと呼ばれ,わが国でも実装に向けた取り組みが進められている。通常,ホルマリン固定パラフィン包埋標本を用い,amplicon sequencingにより体細胞変異などを検索する。それらにはプレアナリシス段階からポストアナリシス段階に分けられるが,それぞれの過程において品質保証,精度管理が必要である。実地臨床では,それらの遺伝子解析結果をレポートとして提出することが求められ,そのレポートを適切に作成するためのクリニカルシーケンスチームを構成する専門家の人材育成が急務である。